एक मजबूत पार्टी बनाने की उम्मीदों के लिए बीकेडी के भीतर कुछ तत्वों के साथ विवाद की भी आवश्यकता थी: चरण सिंह ने खुद को राष्ट्रीय कार्यकारिणी के नेता महामाया बाबू और बंगाल अध्याय के नेता अजय मुखर्जी के साथ लगातार असहमत पाया। बंगाल खेमे ने - चेतावनियों के बावजूद - सीपीआई (एम) और ज्योति बसु के साथ संबंध बनाए रखे थे, जिसे पार्टी ने आपत्तिजनक पाया। यह स्पष्ट होता जा रहा था कि बीकेडी केवल उन लोगों के साथ अलग होकर ही काम कर सकता है जो कम्युनिस्टों और अन्य विवादास्पद तत्वों के साथ गठबंधन करने के इच्छुक हैं। जुलाई में अजय मुखर्जी का इस्तीफा स्वीकार कर लिया गया और बंगाल इकाई का पुनर्गठन भी किया गया। सिंह बीकेडी पर अपनी वैचारिक और राजनीतिक पकड़ मजबूत कर रहे थे।